Onderzoeker in Natural Language Processing in Health Data Science

Werken bij Amsterdam UMC

Onderzoeker in Natural Language Processing in Health Data Science

Wij zijn op zoek naar een gemotiveerde postdoc onderzoeker of ervaren PhD kandidaat op het gebied van de ontwikkeling, evaluatie en implementatie van Natural Language Processing (NLP) voor de gezondheidszorg.

Wat ga je onderzoeken?

De positie is ingebed binnen de afdeling Cardiologie en richt zich op de klinische evaluatie, implementatie en technische optimalisatie van technieken voor natuurlijke taalverwerking, met een specifieke focus op het gebruik van large language models (LLMs) voor verschillende taken. Concreet zal je bijdragen aan verschillende lopende projecten, gericht op:

• LLM-gebaseerde structurering van klinische notities voor geoptimaliseerde data-extractie,
• het gebruik van LLM-systemen voor het volgen van richtlijnen in de klinische praktijk, en
• ontwikkeling en testen van AI-ondersteunde klinische beslissingsondersteuningssystemen.

Deze projecten zijn ingebed in de EU Horizon DataTools4Heart, AI4HF en AIXPERT-projecten, die zich richten op de ontwikkeling van betrouwbare AI-tools in de cardiologie.

Wat ga je doen?

Wij zijn op zoek naar een postdoc onderzoeker of PhD student die:

• Enthousiast is om verantwoorde NLP-methoden te ontwerpen, implementeren en evalueren in de context van verschillende projecten;
• Nauw samenwerkt met meer technische postdoc onderzoekers om state-of-the-art LLM te ontwikkelen met een sterke focus op toepassing binnen het cardiologische zorgdomein;
• Een verbindende factor is tussen de technische ontwikkelingen en eisen vanuit het klinische vakgebied om bij te dragen aan het ontwikkelen van klinisch goed toepasbare algoritmen;
• De klinische evaluatie en implementatie van de ontwikkelde modellen opzet en uitwerkt, daarmee nauw samenwerkt met de postdoc onderzoekers die de algoritmen ontwikkelen en artsen bij de evaluatie daarvan;
• De kans krijgt om nieuwe technieken toe te passen op klinisch relevante problemen in de cardiologie, die samen met medische specialisten gedefinieerd zullen worden.

De voorkeur gaat uit naar een achtergrond in technische geneeskunde of klinische technologie.

Wat neem je mee?

Wij zijn op zoek naar een zeer gemotiveerde postdoc onderzoeker met een sterke technologische en klinische achtergrond (profiel technische geneeskunde of klinische technologie) bij voorkeur met kennis van systemen voor natuurlijke taalverwerking.

Verder breng je mee:

• Sterke klinische en technische achtergrond, bij voorkeur in technische geneeskunde of een vergelijkbaar vakgebied;
• Ervaring met klinische evaluatie- en implementatiestudies en vermogen om technische en klinische kennis te combineren voor het ontwerpen en uitvoeren van klinische evaluatie- en implementatiestudies;
• Praktijkervaring in machine learning, medische informatica en/of data science;
• Goede beheersing van de Nederlandse (C1) en Engelse taal, zowel mondeling als schriftelijk.

Niet vereist, maar wel nuttig:

• Ervaring met voorspellende modellering, data-harmonisatie en ontologieën; Ervaring met klinische data en/of cardiologie;
• Bijdrage aan open-source projecten.

Wat bieden we jou?

• Volledig gefinancierde postdoctoraal positie: wij bieden een aanstelling voor één jaar (12 maanden) met de intentie om deze met nog eens 24 maanden te verlengen, voor in totaal 3 jaar.
• Een vliegende start van jouw carrière in het onderzoekswerk;
• Alle ruimte voor jouw drive om de zorg van morgen vorm te geven;
• Werken aan grootschalig én eigen onderzoek, met gemotiveerde collega’s uit alle hoeken van de wereld;
• Je treedt in dienst bij Amsterdam UMC Research BV;
• Je kunt op een laptop werken en bent niet locatie gebonden.
• Inschaling in salarisschaal 10: € 3.493 tot € 5.504 bruto als Postdoc, indien je als PhD aangesteld wordt valt de inschaling in salarisschaal OIO: € 3.017 tot € 3.824 bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van opleiding en ervaring) en een eindejaarsuitkering van 8,3%.
• Vakantie-uren: 190,4 uur per jaar bij een fulltime dienstverband en een mogelijkheid om uren bij te sparen;
• Pensioenopbouw bij BeFrank, een modern, begrijpelijk en eerlijk geprijsd pensioen;
• Bij 7 km of meer (enkele reis) 100% OV-vergoeding en bij eigen vervoer €0,18 per km tot maximaal 40 km enkele reis;
• Kom je liever lopend of op de fiets? Maak gebruik van onze goede fietsregeling. Je ontvangt een vergoeding à €0,18 per km.

Waar ga je werken?

Je wordt aangesteld in zowel de afdeling Medische Informatica als het Amsterdam Center for Computation Cardiology van Amsterdam UMC. Je zult nauw samenwerken met leden van beide afdelingen. Je werkt in een team samen met dr. Stephan van der Zwaard, dr. Noman Dormosh, dr. Marcel Alberti, dr. Machteld Boonstra en prof. Folkert Asselbergs.

Dr. Van der Zwaard is de klinisch data-architect en richt zich op het hergebruik van EPD-gegevens voor onderzoeksdoeleinden en het implementeren van dergelijke pipelines binnen Amsterdam UMC. Dr. Stephan van der Zwaard, Klinisch Data-Architect

Dr. Dormosh is een postdoctoraal onderzoeker die zich richt op de klinische toepassing van LLM's. Dr. Noman Dormosh, Postdoctoraal Onderzoeker

Dr. Alberti is de medeoprichter van HealthSage AI en leidt het wetenschappelijke team binnen HealthSage AI dat zich richt op de implementatie, optimalisatie en evaluatie van het HealthSage AI Large Language Model. Dr. Marcel Alberti, Medeoprichter HealthSage AI

Dr. Boonstra is een postdoctoraal onderzoeker met een achtergrond in technische geneeskunde, expertise in elektrocardiografische beeldvorming en interesse in multi-modale AI. Dr. Machteld Boonstra, Postdoctoraal Onderzoeker

Prof. Asselbergs is cardioloog en geïnteresseerd in precisiegeneeskunde met behulp van gekoppelde databronnen, zoals draagbare informatie en routinematige zorggegevens verkregen uit elektronische patiëntendossiers, inclusief vrije tekst. Prof. Folkert Asselbergs, Cardioloog

Binnen verschillende consortia zal je samenwerken met diverse klinische centra uit heel Europa, zoals de Universiteit van Barcelona (Spanje), Barcelona Supercomputing Centre (Spanje), Athena Research Centre (Griekenland) en verschillende MKB's: HealthSage AI (Nederland), Lynkeus Srl (Italië), Software Research & Development Corporation (Turkije), Kyklos (GB) en Translated Srl (Italië).

Er is ruimte voor de individuele onderzoeker om internationale ervaring op te doen. Naast het verwerven van medische en gezondheidsinformatica-expertise, vinden we persoonlijke ontwikkeling belangrijk, ook buiten de traditionele kaders van wetenschappelijk onderzoek. Diversiteit, ruimte voor persoonlijke inbreng, autonomie en energieke werkprocessen zijn sleutelwoorden die de groep kenmerken.

Amsterdam UMC Research BV ondersteunt wetenschappelijk onderzoek zonder winstoogmerk. Hiermee voorzien we onderzoekers in alles wat ze nodig hebben om te kunnen excelleren. Zo bieden onze principal investigators (PI's) en projectleiders begeleiding op het gebied van projectbeheer, finance en human resources. Bij medisch-wetenschappelijke onderzoeksprojecten wordt daarnaast ook ondersteuning op juridisch vlak geboden.

We omarmen verschillen. Als mensen zich veilig en op hun plek voelen, floreren ze. We streven naar gelijke kansen voor iedereen. Er is ruimte voor een ieders cultuur, afkomst, ideeën en creativiteit.