Research analist NGS immuniteit infectieziekten

Word jij enthousiast van next generation sequencing (NGS) en geconcentreerd pipetteren in een lab? Mede door jouw werk draagt het RIVM bij aan de volksgezondheid door te zorgen voor een betere bescherming tegen infectieziekten.

Dit ga je doen

We onderzoeken immuunreacties op vaccinaties en infecties en onderzoeken immuunmechanismen die betrokken zijn bij de bescherming tegen infectieziekten. Als research analist draag jij hieraan bij door middel van onder andere NGS.

Deze rol is ontstaan doordat er veel vraag is naar NGS en het huidige team van analisten dit niet erbij kon doen. Je zult nauw samenwerken met analisten uit verschillende onderzoeksteams die de eerste stappen in de samplebewerking uitvoeren, omdat deze zeer verschillend van aard zijn. Afhankelijk van de samples zul je de nucleïnezuurextractie, library preparation en het sequencen uitvoeren en optimaliseren. Hiervoor maken we gebruik van verschillende NGS kits afhankelijk van het doel van het onderzoek. Een deel van dit werk is vrij repetitief, maar moet ook met grote nauwkeurigheid worden uitgevoerd. Door veel te werken met de diverse NGS kits ontwikkel jij jouw vaardigheden hierin en word jij de NGS specialist binnen het team.

Sta ik nou echt de hele dag te pipetteren? Nee, maar wel een groot deel van je tijd. Wat doe je nog meer?

• Weinig collega’s hebben tijd of durven zich te wagen aan het finetunen, kalibreren en instellen van onze pipetteerrobot. Tem jij deze wildebras wel dan mag je hem/haar een naam geven!
• Ook kun je ingezet worden voor andere moleculaire technieken, zoals qPCR.
• Alle experimenten leg je nauwgezet vast in een labjournaal en je communiceert met de onderzoeker en bioinformaticus over de uitslag van het sequencen.

Waar kom je te werken

Het centrum Immunologie van Infectieziekten en Vaccins (IIV) van het RIVM is het kenniscentrum van de overheid op het gebied van de immunologie van infectieziekten en vaccins. Onder het centrum vallen vier afdelingen en jouw functie valt binnen de afdeling immuunmechnismen-immunologische modellen (IIM), maar je zult ingezet worden op projecten die binnen meerdere afdelingen van het centrum lopen.

Je komt te werken voor verschillende teams die aangestuurd worden door enthousiaste onderzoekers en die ondersteund worden door 1-2 analisten waarmee je nauw zult samenwerken. In de meeste teams zitten ook postdocs, promovendi of studenten. Momenteel werken er zo’n 5 teams regelmatig met NGS. We werken hybride, maar in jouw geval zul je voornamelijk op het laboratorium zijn, maar als je bijvoorbeeld resultaten moet uitwerken dan kan dat ook thuis.

De kernmissie van het centrum is het verstrekken van informatie en advies over de effectiviteit van vaccins, vaccinatiestrategieën en immuunreacties tegen infectieziekten aan partijen binnen de overheid en aan het algemene publiek. Ter ondersteuning van deze taak is het onderzoek bij IIV gericht op het optimaliseren van de effectiviteit van huidige en toekomstige vaccinatieprogramma's, immunosurveillance, leeftijdsgerelateerde werkzaamheid van de immuunresponsen en correlaten van bescherming. Hierbij werkt het centrum intensief samen met andere kenniscentra van het RIVM en nationale en internationale samenwerkingspartners gespecialiseerd in immunologie, microbiologie, epidemiologie en uitbraakbeheersing van infectieziekten.

Een groot deel van het onderzoek in dit centrum richt zich op hoe verschillende cellen van het immuunsysteem reageren op een vaccinatie of infectie. Om dit in detail te kunnen bestuderen maken we gebruik van verschillende NGS technieken die het transcriptoom van deze cellen in kaart kunnen brengen. We doen dit op bulk cellen (RNAseq), maar ook op het niveau van een enkele cel (single cell RNAseq). Daarnaast implementeren we momenteel ATACseq, CITEseq en TCR/BCRseq methodieken om in nog groter detail de reactie van immuuncellen op een vaccinatie of infectie te bestuderen. Voor het onderzoek naar de rol van het microbioom bij de immuunrespons zetten we 16S rRNA en metagenomics sequencing technieken in.

Uniek aan deze baan

Je komt te werken voor verschillende teams die aan heel gevarieerde onderzoeken werken naar het begrijpen van immuniteit tegen infectieziekten. Je werkt nauw samen met research analisten en onderzoekers die een passie hebben voor onderzoek dat bijdraagt aan de publieke gezondheid. Je werkt op ruime laboratoria, met verschillende innovatieve ‘state of the art’ technieken. Naast de ervaring die je meebrengt, is er ruimte om nieuwe technieken te leren en te pionieren met robotisering.

Functie-eisen

Wie zoeken wij

Iedereen maakt fouten, jij ook. Dus je gaat dagen hebben waarop je je resultaten de prullenbak in hebt kunnen gooien. Dat overkomt iedereen! Maar jij durft hier ook open over te communiceren, zodat we samen de schade kunnen beperken. Op de andere dagen werk je nauwkeurig en produceer jij betrouwbare resultaten. Er zit een bepaalde complexiteit en repetitiviteit in het werk, waar jij blij van wordt. Als nauwkeurig en herhaling niet in jouw woordenboek staan dan is dit niet de juiste rol voor jou. Wat zoeken wij nog meer:

• Je hebt een hbo opleiding in een biologische of biomedische richting.
• Je hebt meerdere jaren praktische ervaring met verschillende Next Generation Sequencing (NGS) technieken. Ervaring met andere moleculaire technieken (zoals qPCR) is een pré
• Je bent zelfstandig in het uitvoeren van experimenten, en werkt tevens goed in verschillende teams.
• Je beschikt over goede communicatieve vaardigheden met een goede beheersing van de Nederlandse en Engelse taal.