Postdoc molecular neurobiology and data modeling

Postdoc molecular neurobiology and data modeling

Ben jij enthousiast om aan de slag te gaan als ervaren wetenschapper in bio-informatica of computationele biologie voor de CNCR in Amsterdam voor drie jaar? Solliciteer direct!

Wat ga je onderzoeken?

Het project waar je aan gaat werken heet GO-CAM-modellering van synaptische functies in SynGO.

Synapsen zijn de rekeneenheden van de hersenen en synaptische dysregulatie staat centraal bij veel hersenaandoeningen ('synaptopathieën'), waaronder autisme, verstandelijke beperking en talloze zeldzame hersenaandoeningen. SynGO is een wereldwijd consortium van vooraanstaande laboratoria die synaptische functies hebben geannoteerd met behulp van een nieuw Gene Ontology-framework dat nu de standaard in het veld is. Het consortium heeft een kennisbank van synaptische genen gegenereerd, opgebouwd in samenwerking met het Broad Institute in Boston en de Simons Foundation in New York.

Het huidige project beoogt de informatie uit twee eerdere projecten (SynGO1-2) te benutten om moleculaire padmodellen ('causale modellen') te bouwen voor synaptische signaaltransductiepaden met behulp van gevestigde modelleringstools, zoals GO-CAM's.

Van de wetenschapper in dit project wordt verwacht dat hij nauw samenwerkt met experts wereldwijd die paden hebben gedefinieerd op basis van eerder experimenteel werk, en dat hij aanzienlijke tijd in de ...

Wat ga je doen?

• ontwikkel en implementeer je genfunctie- en interactienetwerken in padmodellen, waarschijnlijk in GO-CAM;
• vertaal je synaptische biologische paden naar causale modellen in samenwerking met synaptische experts;
• werk je samen met interdisciplinaire teams wereldwijd om diverse experimentele gegevens te integreren;
• voeg je modellen toe aan de SynGO-kennisbank en begeleid onderzoekers in het veld bij het gebruik van de modellen;
• publiceer je causale modellen in de beste peer-reviewed tijdschriften en verstrek voortgangsrapportages aan financieringsbronnen.

Wat neem je mee?

• gepromoveerd in de moleculaire (neuro)biologie, affiniteit met datamodellering;
• bij voorkeur minimaal 5 jaar postdoctorale ervaring;
• bekwaamheid in programmeertalen (bijv. Python, R) en ervaring met databases (bijv. SQL);
• eerdere ervaring met Gene Ontology-annotatie, GO-CAM's en connecties met GO-CAM-community's is een pré;
• sterke motivatie om een ​​carrière in de wetenschap na te streven;
• uitstekende beheersing van de Engelse taal.

Wat bieden we jou?

• Een vliegende start van jouw carrière in het onderzoekswerk.
• Alle ruimte voor jouw drive om de zorg van morgen vorm te geven.
• Werken aan grootschalig én eigen onderzoek, met gemotiveerde collega’s uit alle hoeken van de wereld.
• Je treedt in dienst bij Amsterdam UMC Research BV.
• Een contract voor de duur van 12 maanden. Bij een positieve beoordeling van de aanstelling wordt het contract met 2 jaar verlengd.
• Inschaling in salarisschaal 11: € 4.678 tot € 6.402 bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van opleiding en ervaring) en een eindejaarsuitkering van 8,3%.
• Vakantie-uren: 190,4 uur per jaar bij een fulltime dienstverband en een mogelijkheid om uren bij te sparen.
• Pensioenopbouw bij BeFrank, een modern, begrijpelijk en eerlijk geprijsd pensioen.
• Bij 7 km of meer (enkele reis) 100% OV-vergoeding en bij eigen vervoer €0,18 per km tot maximaal 40 km enkele reis.
• Kom je liever lopend of op de fiets? Maak gebruik van onze goede fietsregeling. Je ontvangt een vergoeding à €0,18 per km.

Waar ga je werken?

De afdeling Humane Genetica hecht veel waarde aan teamwerk, wat resulteert in een positieve samenwerkingssfeer en prestaties op hoog niveau, waaronder het verwerven van subsidies en financiering, publicaties in toonaangevende tijdschriften en samenwerking met de private sector. Je maakt deel uit van het kernteam van het SynGO-consortium, bestaande uit twee hoogleraren, twee universitair docenten en één promovendus. In bredere zin word je verbonden aan gerenommeerde Synapse-expertlabs wereldwijd, die je tijdens het project zult bezoeken.

Amsterdam UMC Research BV ondersteunt wetenschappelijk onderzoek zonder winstoogmerk. Hiermee voorzien we onderzoekers in alles wat ze nodig hebben om te kunnen excelleren. Zo bieden onze principal investigators (PI's) en projectleiders begeleiding op het gebied van projectbeheer, finance en human resources. Bij medisch-wetenschappelijke onderzoeksprojecten wordt daarnaast ook ondersteuning op juridisch vlak geboden.

We omarmen verschillen. Als mensen zich veilig en op hun plek voelen, floreren ze. We streven naar gelijke kansen voor iedereen. Er is ruimte voor een ieders cultuur, afkomst, ideeën en creativiteit.

Let op: Sollicitaties per e-mail worden niet in behandeling genomen.

De startdatum is tussen 1 september 2025 en 1 januari 2026.

Heb je vragen over deze functie? Neem dan gerust contact op met Guus Smit via guus.smit@vu.nl.

Een referentiecheck, screening en aannametest kunnen onderdeel zijn van de procedure. Als je bij ons in dienst treedt, vragen we je om een ​​VOG (Verklaring Omtrent het Gedrag).

Interne kandidaten krijgen bij gelijke geschiktheid voorrang op externe kandidaten.